4 лютого 1990 року згідно з Постановою Ради Міністрів України №25 було прийнято рішення «Про створення державного заповідника «Медобори» у Тернопільській області».
Заповідник, як природоохоронна науково-дослідна установа, створений з метою охорони унікального природного ландшафту Подільських Товтр та усього різноманіття рослинного і тваринного світу.
